2009-2010赛季由于阿德巴约的离队，范佩西的位置又有改变，在阿森纳主打的433战术里，范佩西被推上了突前前锋的位置。在阿森纳联赛首轮击溃埃弗顿的比赛中，范佩西奉献了两次助攻。
在阿森纳二比四大败给曼城比赛中，范佩西被阿德巴约踢中了脸部，赛后他怒斥阿德巴约的野蛮行径。之后范佩西持续出色表现，2009年10月六场比赛进了六球，还被评为了英超10月最佳球员，这是他第二次获此殊荣。然而范佩西的良好状态再次被伤病打断，2009年11月范佩西在参加荷兰国家队对阵意大利国家队的比赛中，范佩西的脚踝被基耶利尼铲伤，范佩西为此竟然休息了五个月时间，直到4月25日的英超倒数第五轮的比赛才复出。
2010-2011赛季里范佩西被授予了象征球队核心的10号球衣。可惜范佩西在赛季初期仅打了三场比赛就宣告重伤，受伤的位置还是脚踝，他这一伤又是两个多月，而且后来不断反复，难以保证状态，在此阶段阿森纳在2010年夏季引进的前锋查马赫表现优异，使阿森纳球迷一度都忘记了范佩西。
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