但是在2010年12月18日布莱克本流浪者主场一比一战平西汉姆的比赛中，菲尔·琼斯下半场五十七分钟替补克里斯托弗·桑巴出场，但仅十分钟便因与卡尔顿·科尔发生碰撞受伤离场，赛后证实膝盖严重受伤，2011年2月15日菲尔·琼斯又与布莱克本延长一年合约，而原本被预计会缺席整个赛季的他也在2011年3月11日对阵布莱克浦的比赛中复出。
菲尔·琼斯是在2010年11月27日曼联对阵布莱克本的比赛中首次吸引了曼联主教练弗格森的关注，随后在2011年1月曼联方面曾经对布莱克本提出购买琼斯的建议，但被布莱克本所拒绝。在2011年6月曼联再次对菲尔·琼斯报价并且直接动用了琼斯合同中的一千六百万解约金的条款，琼斯在6月前往丹麦参加U-21世青赛的前一天在未和曼联签约的情况下接受了曼联安排的体检，这令布莱克本方面非常愤怒。
布莱克本表示己方不必遵守解约金条款，此时利物浦队也像布莱克本提出了两千两百万磅的报价，形势瞬间复杂化。在6月9日弗格森迅速结束休假亲自赶到兰开夏郡的琼斯家里，和琼斯的父母进行了面谈。之后琼斯告知布莱克本高层，自己对利物浦不感兴趣，一心只想加入曼联，而此时曼联也将报价提高了五十万，并且还为布莱克本提供了四百万的额外浮动条款，最终布莱克本在6月13日接受了曼联的报价，琼斯顺利加盟曼联。
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